Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF7Q6Q0C0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF7Q6Q0C0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms