Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC137Q6PK04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC137Q6PK04 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms