Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6P435 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6P435 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6P435 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6P435 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6P435 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6P435 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms