Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDF6Q6KF10 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF6Q6KF10 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF6Q6KF10 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms