Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLFN12LQ6IEE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLFN12LQ6IEE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms