Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD5Q6GMV2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMYD5Q6GMV2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms