Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCTP1Q6DN14 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCTP1Q6DN14 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms