Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms