Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC8Q6A555 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC8Q6A555 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms