Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA2Q69YH5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms