Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MALRD1Q5VYJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALRD1Q5VYJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms