Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD13Q5VXD3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms