Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF3Q5VWG9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF3Q5VWG9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms