Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms