Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC39BQ5VTQ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms