Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q5VSD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms