Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SAMD5Q5TGI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAMD5Q5TGI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms