Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP2Q5T6F2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP2Q5T6F2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms