Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE27Q5T4F4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFYVE27Q5T4F4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFYVE27Q5T4F4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms