Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LDLRAP1Q5SW96 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAP1Q5SW96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms