Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACER2Q5QJU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACER2Q5QJU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACER2Q5QJU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACER2Q5QJU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms