Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC158Q5M9N0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms