Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRPB2Q5JXA9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRPB2Q5JXA9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIRPB2Q5JXA9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIRPB2Q5JXA9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIRPB2Q5JXA9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms