Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD12Q587J7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD12Q587J7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD12Q587J7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms