Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBK1Q52WX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SBK1Q52WX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms