Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FNDC1Q4ZHG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms