Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KHDC1Q4VXA5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KHDC1Q4VXA5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms