Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB8Q3ZCM7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB8Q3ZCM7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms