Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms