Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDRF1Q3B7T1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDRF1Q3B7T1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms