Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TWISTNBQ3B726 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TWISTNBQ3B726 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms