Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTU2Q2VPK5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms