Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms