Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTN1Q16799 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTN1Q16799 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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