Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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HIST2H2ACQ16777 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST2H2ACQ16777 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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