Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK4Q16654 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PDK4Q16654 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PDK4Q16654 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PDK4Q16654 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PDK4Q16654 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDK4Q16654 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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