Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SGCAQ16586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SGCAQ16586 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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