Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA3Q16281 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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