Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALX1Q15699 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALX1Q15699 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALX1Q15699 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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