Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCEA2Q15560 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCEA2Q15560 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms