Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RYR3Q15413 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYR3Q15413 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYR3Q15413 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RYR3Q15413 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RYR3Q15413 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYR3Q15413 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RYR3Q15413 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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RYR3Q15413 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RYR3Q15413 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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RYR3Q15413 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYR3Q15413 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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RYR3Q15413 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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RYR3Q15413 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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RYR3Q15413 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYR3Q15413 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYR3Q15413 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RYR3Q15413 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RYR3Q15413 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RYR3Q15413 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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