Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IRF4Q15306 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF4Q15306 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF4Q15306 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms