Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKD1Q15139 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKD1Q15139 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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