Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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NCF4Q15080 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NCF4Q15080 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCF4Q15080 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NCF4Q15080 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
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NCF4Q15080 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NCF4Q15080 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCF4Q15080 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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