Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCLAFQ15004 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCLAFQ15004 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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