Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPHQ15003 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCAPHQ15003 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPHQ15003 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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