Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3AQ14563 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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