Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL4A6Q14031 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A6Q14031 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A6Q14031 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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