Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
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CNGB1Q14028 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CNGB1Q14028 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
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