Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CIRBPQ14011 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIRBPQ14011 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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